SETD6

SETD6
ساختارهای موجود
PDB	جستجوی هم‌ساخت‌شناسی: PDBe RCSB
فهرست شناسه‌های PDB
	3QXY, 3RC0
معین‌کننده‌ها
نام‌های دیگر	SETD6, SET domain containing 6, SET domain containing 6, protein lysine methyltransferase
شناسه‌های بیرونی	OMIM: 616424; MGI: 1913333; HomoloGene: 38743; GeneCards: SETD6; OMA:SETD6 - orthologs
موقعیت ژن (انسان)
کروموزوم	کروموزوم ۱۶ (انسان)
پایان	58,523,842 bp
موقعیت ژن (موش)
کروموزوم	کروموزوم ۸ (موش)
پایان	95,719,010 bp
الگوی گسترش RNA
	بیشترین بیان در
	secondary oocyte; ; body of pancreas; ; right hemisphere of cerebellum; ; tendon of biceps brachii; ; right uterine tube; ; right lobe of thyroid gland; ; left lobe of thyroid gland;
	بیشترین بیان در
	otic placode; ; Vesicula otica;
	داده‌های بیشتر بیان
	ناموجود
هستی‌شناسی ژن
عملکرد ملکولی	methyltransferase activity; transferase activity; پیوند پروتئینی; NF-kappaB binding; protein-lysine N-methyltransferase activity;
ترکیبات سلولی	هسته سلول; نوکلئوپلاسم; سیتوزول;
فرایند زیستی	stem cell population maintenance; histone lysine methylation; متیل‌دار کردن; negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity; peptidyl-lysine monomethylation; stem cell differentiation; regulation of inflammatory response;
	منابع: آمیگو / کوئیک‌گو
هم‌ساخت‌شناسی
	79918
	66083
	ENSG00000103037
	ENSMUSG00000031671
	Q8TBK2
	Q9CWY3
	NM_001160305; NM_024860
	NM_001035123
	NP_001153777; NP_079136
	NP_001030295; NP_001355283
	ویکی‌داده
مشاهده/ویرایش انسان	مشاهده/ویرایش موش

پروتئین ۶ حاوی دومین SET (انگلیسی: SET domain containing 6) یک پروتئین است که در انسان توسط ژن «SETD6» کُدگذاری می‌شود.^[۵]

نقصان یا کاهش SETD6 در سلول‌های گوناگون، سبب تغییرات چشمگیر در بیان ژن‌های Wnt/β-catenin می‌گردد.^[۶]

در پاسخ به استرس اکسیداتیو، میزان پروتئین و آران‌ای پیام‌رسان SETD6 به میزان قابل توجهی کاهش می‌یابد.^[۷]

منابع

1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000103037 – Ensembl, May 2017
1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000031671 – Ensembl, May 2017
↑ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
↑ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
↑ "Entrez Gene: SET domain containing 6".
↑ Vershinin Z, Feldman M, Chen A, Levy D (March 2016). "PAK4 Methylation by SETD6 Promotes the Activation of the Wnt/β-Catenin Pathway". The Journal of Biological Chemistry. 291 (13): 6786–95. doi:10.1074/jbc.M115.697292. PMC 4807267. PMID 26841865.{{cite journal}}: نگهداری یادکرد:doi رایگان بی‌نشان (رده)
↑ Chen A, Feldman M, Vershinin Z, Levy D (February 2016). "SETD6 is a negative regulator of oxidative stress response". Biochimica et Biophysica Acta. 1859 (2): 420–7. doi:10.1016/j.bbagrm.2016.01.003. PMID 26780326.

مشارکت‌کنندگان ویکی‌پدیا. «SETD6». در دانشنامهٔ ویکی‌پدیای انگلیسی، بازبینی‌شده در ۳ اکتبر ۲۰۱۹.

برای مطالعهٔ بیشتر

Weil LE, Shmidov Y, Kublanovsky M, Morgenstern D, Feldman M, Bitton R, Levy D (October 2018). "Oligomerization and Auto-methylation of the Human Lysine Methyltransferase SETD6". Journal of Molecular Biology. 430 (21): 4359–4368. doi:10.1016/j.jmb.2018.08.028. PMID 30189201.
Kublanovsky M, Aharoni A, Levy D (July 2018). "Enhanced PKMT-substrate recognition through non active-site interactions". Biochemical and Biophysical Research Communications. 501 (4): 1029–1033. doi:10.1016/j.bbrc.2018.05.103. PMID 29778536.
Feldman M, Levy D (January 2018). "Peptide inhibition of the SETD6 methyltransferase catalytic activity". Oncotarget. 9 (4): 4875–4885. doi:10.18632/oncotarget.23591. PMC 5797019. PMID 29435148.
Martín-Morales L, Feldman M, Vershinin Z, Garre P, Caldés T, Levy D (November 2017). "SETD6 dominant negative mutation in familial colorectal cancer type X". Human Molecular Genetics. 26 (22): 4481–4493. doi:10.1093/hmg/ddx336. PMID 28973356.
Chang Y, Levy D, Horton JR, Peng J, Zhang X, Gozani O, Cheng X (August 2011). "Structural basis of SETD6-mediated regulation of the NF-kB network via methyl-lysine signaling". Nucleic Acids Research. 39 (15): 6380–9. doi:10.1093/nar/gkr256. PMC 3159447. PMID 21515635.
Levy D, Liu CL, Yang Z, Newman AM, Alizadeh AA, Utz PJ, Gozani O (October 2011). "A proteomic approach for the identification of novel lysine methyltransferase substrates". Epigenetics & Chromatin. 4: 19. doi:10.1186/1756-8935-4-19. PMC 3212905. PMID 22024134.{{cite journal}}: نگهداری یادکرد:doi رایگان بی‌نشان (رده)</ref>

این یک مقالهٔ خرد زیست‌شناسی مولکولی است. می‌توانید با گسترش آن به ویکی‌پدیا کمک کنید.

[refGRCh38Ensembl-1] 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000103037 – Ensembl, May 2017

[refGRCm38Ensembl-2] 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000031671 – Ensembl, May 2017

[3] "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[4] "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[entrez-5] "Entrez Gene: SET domain containing 6".

[6] Vershinin Z, Feldman M, Chen A, Levy D (March 2016). "PAK4 Methylation by SETD6 Promotes the Activation of the Wnt/β-Catenin Pathway". The Journal of Biological Chemistry. 291 (13): 6786–95. doi:10.1074/jbc.M115.697292. PMC 4807267. PMID 26841865.{{cite journal}}: نگهداری یادکرد:doi رایگان بی‌نشان (رده)

[7] Chen A, Feldman M, Vershinin Z, Levy D (February 2016). "SETD6 is a negative regulator of oxidative stress response". Biochimica et Biophysica Acta. 1859 (2): 420–7. doi:10.1016/j.bbagrm.2016.01.003. PMID 26780326.

[۱]

[۲]

[۳]

[۴]

[۵]

[۶]

[۷]