DMBT1

DMBT1
Ідентифікатори
Символи	DMBT1, GP340, muclin, SAG, deleted in malignant brain tumors 1, SALSA
Зовнішні ІД	OMIM: 601969 MGI: 106210 HomoloGene: 68990 GeneCards: DMBT1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0008329 pattern recognition receptor activity; • calcium-dependent protein binding; • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • zymogen binding; • lipopolysaccharide binding; • зв'язування з ДНК; • scavenger receptor activity; • lipoteichoic acid binding; • heparan sulfate binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • phagocytic vesicle membrane; • мембрана; • zymogen granule membrane; • extracellular region; • екзосома; • extrinsic component of membrane; • міжклітинний простір; • зовнішня поверхня плазматичної мембрани; • GO:0005578 позаклітинний матрикс;
Біологічний процес	• диференціація клітин; • epithelial cell differentiation; • розвиток багатоклітинного організму; • defense response to virus; • транспорт білків; • вроджений імунітет; • GO:0022415 viral process; • pattern recognition receptor signaling pathway; • рецептор-опосередкований ендоцитоз; • GO:0015915 транспорт; • induction of bacterial agglutination; • GO:0051636 defense response to Gram-negative bacterium; • GO:0051637 defense response to Gram-positive bacterium; • antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide; • vesicle-mediated transport; • ендоцитоз;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	1755
	12945
	ENSG00000187908
	ENSMUSG00000047517
	Q9UGM3
	Q60997
	NM_004406; NM_007329; NM_017579; NM_001320644; NM_001377530
	NM_007769; NM_001347632
	NP_001307573; NP_004397; NP_015568; NP_060049
	NP_001334561; NP_031795
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

DMBT1 (англ. Deleted in malignant brain tumors 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 413 амінокислот, а молекулярна маса — 260 735^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGISTVILEM	CLLWGQVLST	GGWIPRTTDY	ASLIPSEVPL	DPTVAEGSPF
PSESTLESTV	AEGSPISLES	TLESTVAEGS	LIPSESTLES	TVAEGSDSGL
ALRLVNGDGR	CQGRVEILYR	GSWGTVCDDS	WDTNDANVVC	RQLGCGWAMS
APGNAWFGQG	SGPIALDDVR	CSGHESYLWS	CPHNGWLSHN	CGHGEDAGVI
CSAAQPQSTL	RPESWPVRIS	PPVPTEGSES	SLALRLVNGG	DRCRGRVEVL
YRGSWGTVCD	DYWDTNDANV	VCRQLGCGWA	MSAPGNAQFG	QGSGPIVLDD
VRCSGHESYL	WSCPHNGWLT	HNCGHSEDAG	VICSAPQSRP	TPSPDTWPTS
HASTAGPESS	LALRLVNGGD	RCQGRVEVLY	RGSWGTVCDD	SWDTSDANVV
CRQLGCGWAT	SAPGNARFGQ	GSGPIVLDDV	RCSGYESYLW	SCPHNGWLSH
NCQHSEDAGV	ICSAAHSWST	PSPDTLPTIT	LPASTVGSES	SLALRLVNGG
DRCQGRVEVL	YRGSWGTVCD	DSWDTNDANV	VCRQLGCGWA	MLAPGNARFG
QGSGPIVLDD	VRCSGNESYL	WSCPHNGWLS	HNCGHSEDAG	VICSGPESSL
ALRLVNGGDR	CQGRVEVLYR	GSWGTVCDDS	WDTNDANVVC	RQLGCGWATS
APGNARFGQG	SGPIVLDDVR	CSGHESYLWS	CPNNGWLSHN	CGHHEDAGVI
CSAAQSRSTP	RPDTLSTITL	PPSTVGSESS	LTLRLVNGSD	RCQGRVEVLY
RGSWGTVCDD	SWDTNDANVV	CRQLGCGWAT	SAPGNARFGQ	GSGPIVLDDV
RCSGHESYLW	SCPHNGWLSH	NCGHHEDAGV	ICSVSQSRPT	PSPDTWPTSH
ASTAGPESSL	ALRLVNGGDR	CQGRVEVLYR	GSWGTVCDDS	WDTSDANVVC
RQLGCGWATS	APGNARFGQG	SGPIVLDDVR	CSGYESYLWS	CPHNGWLSHN
CQHSEDAGVI	CSAAHSWSTP	SPDTLPTITL	PASTVGSESS	LALRLVNGGD
RCQGRVEVLY	QGSWGTVCDD	SWDTNDANVV	CRQLGCGWAM	SAPGNARFGQ
GSGPIVLDDV	RCSGHESYLW	SCPHNGWLSH	NCGHSEDAGV	ICSASQSRPT
PSPDTWPTSH	ASTAGSESSL	ALRLVNGGDR	CQGRVEVLYR	GSWGTVCDDY
WDTNDANVVC	RQLGCGWAMS	APGNARFGQG	SGPIVLDDVR	CSGHESYLWS
CPHNGWLSHN	CGHHEDAGVI	CSASQSQPTP	SPDTWPTSHA	STAGSESSLA
LRLVNGGDRC	QGRVEVLYRG	SWGTVCDDYW	DTNDANVVCR	QLGCGWATSA
PGNARFGQGS	GPIVLDDVRC	SGHESYLWSC	PHNGWLSHNC	GHHEDAGVIC
SASQSQPTPS	PDTWPTSHAS	TAGSESSLAL	RLVNGGDRCQ	GRVEVLYRGS
WGTVCDDYWD	TNDANVVCRQ	LGCGWATSAP	GNARFGQGSG	PIVLDDVRCS
GHESYLWSCP	HNGWLSHNCG	HHEDAGVICS	ASQSQPTPSP	DTWPTSRAST
AGSESTLALR	LVNGGDRCRG	RVEVLYQGSW	GTVCDDYWDT	NDANVVCRQL
GCGWAMSAPG	NAQFGQGSGP	IVLDDVRCSG	HESYLWSCPH	NGWLSHNCGH
HEDAGVICSA	AQSQSTPRPD	TWLTTNLPAL	TVGSESSLAL	RLVNGGDRCR
GRVEVLYRGS	WGTVCDDSWD	TNDANVVCRQ	LGCGWAMSAP	GNARFGQGSG
PIVLDDVRCS	GNESYLWSCP	HKGWLTHNCG	HHEDAGVICS	ATQINSTTTD
WWHPTTTTTA	RPSSNCGGFL	FYASGTFSSP	SYPAYYPNNA	KCVWEIEVNS
GYRINLGFSN	LKLEAHHNCS	FDYVEIFDGS	LNSSLLLGKI	CNDTRQIFTS
SYNRMTIHFR	SDISFQNTGF	LAWYNSFPSD	ATLRLVNLNS	SYGLCAGRVE
IYHGGTWGTV	CDDSWTIQEA	EVVCRQLGCG	RAVSALGNAY	FGSGSGPITL
DDVECSGTES	TLWQCRNRGW	FSHNCNHRED	AGVICSGNHL	STPAPFLNIT
RPNTDYSCGG	FLSQPSGDFS	SPFYPGNYPN	NAKCVWDIEV	QNNYRVTVIF
RDVQLEGGCN	YDYIEVFDGP	YRSSPLIARV	CDGARGSFTS	SSNFMSIRFI
SDHSITRRGF	RAEYYSSPSN	DSTNLLCLPN	HMQASVSRSY	LQSLGFSASD
LVISTWNGYY	ECRPQITPNL	VIFTIPYSGC	GTFKQADNDT	IDYSNFLTAA
VSGGIIKRRT	DLRIHVSCRM	LQNTWVDTMY	IANDTIHVAN	NTIQVEEVQY
GNFDVNISFY	TSSSFLYPVT	SRPYYVDLNQ	DLYVQAEILH	SDAVLTLFVD
TCVASPYSND	FTSLTYDLIR	SGCVRDDTYG	PYSSPSLRIA	RFRFRAFHFL
NRFPSVYLRC	KMVVCRAYDP	SSRCYRGCVL	RSKRDVGSYQ	EKVDVVLGPI
QLQTPPRREE	EPR

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транспорт, транспорт білків, диференціація клітин, противірусний захист, альтернативний сплайсинг. Секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Tino M.J., Wright J.R. (1999). Glycoprotein-340 binds surfactant protein-A (SP-A) and stimulates alveolar macrophage migration in an SP-A-independent manner. Am. J. Respir. Cell Mol. Biol. 20: 759—768. PMID 10101009 doi:10.1165/ajrcmb.20.4.3439
Wu Z., Lee S., Abrams W., Weissman D., Malamud D. (2006). The N-terminal SRCR-SID domain of gp-340 interacts with HIV type 1 gp120 sequences and inhibits viral infection. AIDS Res. Hum. Retroviruses. 22: 508—515. PMID 16796526 doi:10.1089/aid.2006.22.508
Mueller W., Mollenhauer J., Stockhammer F., Poustka A., von Deimling A. (2002). Rare mutations of the DMBT1 gene in human astrocytic gliomas. Oncogene. 21: 5956—5959. PMID 12185598 doi:10.1038/sj.onc.1205733

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2926 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9UGM3 (англ.) . Архів оригіналу за 3 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 10

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2926 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q9UGM3 (англ.) . Архів оригіналу за 3 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]