GRID2

GRID2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	5KCA, 5KC8
Ідентифікатори
Символи	GRID2, GluD2, SCAR18, glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2
Зовнішні ІД	OMIM: 602368 MGI: 95813 HomoloGene: 74399 GeneCards: GRID2
Пов'язані генетичні захворювання
	ожиріння, autosomal recessive spinocerebellar ataxia 18
Онтологія гена
Молекулярна функція	• glutamate receptor activity; • зв'язування з PDZ-доменом; • scaffold protein binding; • активність іонного каналу; • ionotropic glutamate receptor activity; • extracellularly glutamate-gated ion channel activity; • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • сигнальна рецепторна активність; • активність медіатор-залежного іонного каналу, залученого в регуляцію постсинаптичного мембранного потенціалу;
Клітинна компонента	• інтегральний компонент мембрани; • постсинаптична мембрана; • мембрана; • клітинна мембрана; • dendritic spine; • синапс; • інтегральний компонент плазматичної мембрани; • міжклітинні контакти; • ionotropic glutamate receptor complex; • somatodendritic compartment; • parallel fiber to Purkinje cell synapse; • glutamatergic synapse; • integral component of postsynaptic density membrane;
Біологічний процес	• glutamate receptor signaling pathway; • heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules; • regulation of neuron projection development; • synaptic transmission, glutamatergic; • regulation of neuron apoptotic process; • ion transport; • ion transmembrane transport; • ionotropic glutamate receptor signaling pathway; • excitatory postsynaptic potential; • cerebellar granule cell differentiation; • prepulse inhibition; • positive regulation of synapse assembly; • positive regulation of long-term synaptic depression; • excitatory synapse assembly; • regulation of postsynaptic density assembly; • modulation of chemical synaptic transmission;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	2895
	14804
	ENSG00000152208
	ENSMUSG00000071424
	O43424
	Q61625
	NM_001286838; NM_001510
	NM_008167; NM_001370966
	NP_001273767; NP_001501
	NP_032193; NP_001357895
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

GRID2 (англ. Glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 007 амінокислот, а молекулярна маса — 113 356^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEVFPFLLVL	SVWWSRTWDS	ANADSIIHIG	AIFDESAKKD	DEVFRTAVGD
LNQNEEILQT	EKITFSVTFV	DGNNPFQAVQ	EACELMNQGI	LALVSSIGCT
SAGSLQSLAD	AMHIPHLFIQ	RSTAGTPRSG	CGLTRSNRND	DYTLSVRPPV
YLHDVILRVV	TEYAWQKFII	FYDSEYDIRG	IQEFLDKVSQ	QGMDVALQKV
ENNINKMITT	LFDTMRIEEL	NRYRDTLRRA	ILVMNPATAK	SFITEVVETN
LVAFDCHWII	INEEINDVDV	QELVRRSIGR	LTIIRQTFPV	PQNISQRCFR
GNHRISSTLC	DPKDPFAQNM	EISNLYIYDT	VLLLANAFHK	KLEDRKWHSM
ASLSCIRKNS	KPWQGGRSML	ETIKKGGVSG	LTGELEFGEN	GGNPNVHFEI
LGTNYGEELG	RGVRKLGCWN	PVTGLNGSLT	DKKLENNMRG	VVLRVVTVLE
EPFVMVSENV	LGKPKKYQGF	SIDVLDALSN	YLGFNYEIYV	APDHKYGSPQ
EDGTWNGLVG	ELVFKRADIG	ISALTITPDR	ENVVDFTTRY	MDYSVGVLLR
RAEKTVDMFA	CLAPFDLSLW	ACIAGTVLLV	GLLVYLLNWL	NPPRLQMGSM
TSTTLYNSMW	FVYGSFVQQG	GEVPYTTLAT	RMMMGAWWLF	ALIVISSYTA
NLAAFLTITR	IESSIQSLQD	LSKQTEIPYG	TVLDSAVYEH	VRMKGLNPFE
RDSMYSQMWR	MINRSNGSEN	NVLESQAGIQ	KVKYGNYAFV	WDAAVLEYVA
INDPDCSFYT	IGNTVADRGY	GIALQHGSPY	RDVFSQRILE	LQQNGDMDIL
KHKWWPKNGQ	CDLYSSVDTK	QKGGALDIKS	FAGVFCILAA	GIVLSCFIAM
LETWWNKRKG	SRVPSKEDDK	EIDLEHLHRR	VNSLCTDDDS	PHKQFSTSSI
DLTPLDIDTL	PTRQALEQIS	DFRNTHITTT	TFIPEQIQTL	SRTLSAKAAS
GFTFGNVPEH	RTGPFRHRAP	NGGFFRSPIK	TMSSIPYQPT	PTLGLNLGND
PDRGTSI

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, іонних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, синапсах.

Література

Hu W., Zuo J., De Jager P.L., Heintz N. (1998). The human glutamate receptor delta 2 gene (GRID2) maps to chromosome 4q22. Genomics. 47: 143—145. PMID 9465309 doi:10.1006/geno.1997.5108
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з GRID2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4576 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, O43424 (англ.) . Архів оригіналу за 14 жовтня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 4

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з GRID2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4576 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-5] UniProt, O43424 (англ.) . Архів оригіналу за 14 жовтня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]