HDLBP

HDLBP
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1VIG, 1VIH, 2CTE, 2CTF, 2CTJ, 2CTK, 2CTL, 2CTM
Ідентифікатори
Символи	HDLBP, HBP, PRO2900, VGL, high density lipoprotein binding protein
Зовнішні ІД	OMIM: 142695 MGI: 99256 HomoloGene: 38035 GeneCards: HDLBP
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • lipid binding; • зв'язування з нуклеїновими кислотами; • зв'язування з РНК; • зв'язування з кадгерином;
Клітинна компонента	• клітинна мембрана; • клітинне ядро; • high-density lipoprotein particle; • цитоплазма; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• обмін жирів; • steroid metabolic process; • lipid transport; • cholesterol metabolic process; • high-density lipoprotein particle clearance; • GO:0015915 транспорт;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	3069
	110611
	ENSG00000115677
	ENSMUSG00000034088
	Q00341
	Q8VDJ3
NM_001243900; NM_005336; NM_203346; NM_001320965; NM_001320966;
	NM_001320967
	NM_001301364; NM_133808; NM_001357556
NP_001230829; NP_001307894; NP_001307895; NP_001307896; NP_005327;
	NP_976221
	NP_001288293; NP_598569; NP_001344485
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

HDLBP (англ. High density lipoprotein binding protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 268 амінокислот, а молекулярна маса — 141 456^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSSVAVLTQE	SFAEHRSGLV	PQQIKVATLN	SEEESDPPTY	KDAFPPLPEK
AACLESAQEP	SGAWGNKIRP	IKASVITQVF	HVPLEERKYK	DMNQFGEGEQ
AKICLEIMQR	TGAHLELSLA	KDQGLSIMVS	GKLDAVMKAR	KDIVARLQTQ
ASATVAIPKE	HHRFVIGKNG	EKLQDLELKT	ATKIQIPRPD	DPSNQIKITG
TKEGIEKARH	EVLLISAEQD	KRAVERLEVE	KAFHPFIAGP	YNRLVGEIMQ
ETGTRINIPP	PSVNRTEIVF	TGEKEQLAQA	VARIKKIYEE	KKKKTTTIAV
EVKKSQHKYV	IGPKGNSLQE	ILERTGVSVE	IPPSDSISET	VILRGEPEKL
GQALTEVYAK	ANSFTVSSVA	APSWLHRFII	GKKGQNLAKI	TQQMPKVHIE
FTEGEDKITL	EGPTEDVNVA	QEQIEGMVKD	LINRMDYVEI	NIDHKFHRHL
IGKSGANINR	IKDQYKVSVR	IPPDSEKSNL	IRIEGDPQGV	QQAKRELLEL
ASRMENERTK	DLIIEQRFHR	TIIGQKGERI	REIRDKFPEV	IINFPDPAQK
SDIVQLRGPK	NEVEKCTKYM	QKMVADLVEN	SYSISVPIFK	QFHKNIIGKG
GANIKKIREE	SNTKIDLPAE	NSNSETIIIT	GKRANCEAAR	SRILSIQKDL
ANIAEVEVSI	PAKLHNSLIG	TKGRLIRSIM	EECGGVHIHF	PVEGSGSDTV
VIRGPSSDVE	KAKKQLLHLA	EEKQTKSFTV	DIRAKPEYHK	FLIGKGGGKI
RKVRDSTGAR	VIFPAAEDKD	QDLITIIGKE	DAVREAQKEL	EALIQNLDNV
VEDSMLVDPK	HHRHFVIRRG	QVLREIAEEY	GGVMVSFPRS	GTQSDKVTLK
GAKDCVEAAK	KRIQEIIEDL	EAQVTLECAI	PQKFHRSVMG	PKGSRIQQIT
RDFSVQIKFP	DREENAVHST	EPVVQENGDE	AGEGREAKDC	DPGSPRRCDI
IIISGRKEKC	EAAKEALEAL	VPVTIEVEVP	FDLHRYVIGQ	KGSGIRKMMD
EFEVNIHVPA	PELQSDIIAI	TGLAANLDRA	KAGLLERVKE	LQAEQEDRAL
RSFKLSVTVD	PKYHPKIIGR	KGAVITQIRL	EHDVNIQFPD	KDDGNQPQDQ
ITITGYEKNT	EAARDAILRI	VGELEQMVSE	DVPLDHRVHA	RIIGARGKAI
RKIMDEFKVD	IRFPQSGAPD	PNCVTVTGLP	ENVEEAIDHI	LNLEEEYLAD
VVDSEALQVY	MKPPAHEEAK	APSRGFVVRD	APWTASSSEK	APDMSSSEEF
PSFGAQVAPK	TLPWGPKR

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як метаболізм ліпідів, транспорт, метаболізм холестеролу, транспорт ліпідів, метаболізм стероїдів, метаболізм стеролів, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4857 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q00341 (англ.) . Архів оригіналу за 28 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 2

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4857 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q00341 (англ.) . Архів оригіналу за 28 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]