LDB2

LDB2
Ідентифікатори
Символи	LDB2, CLIM1, LDB1, LDB-2, LIM domain binding 2
Зовнішні ІД	OMIM: 603450 MGI: 894670 HomoloGene: 989 GeneCards: LDB2
Онтологія гена
Молекулярна функція	• enzyme binding; • LIM domain binding; • GO:0001104 transcription coregulator activity; • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • регуляторний транскрипційний комплекс; • cell leading edge; • ядерце; • клітинна мембрана;
Біологічний процес	• GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 регуляція транскрипції РНК-полімеразою II; • hair follicle development; • positive regulation of cellular component biogenesis; • epithelial structure maintenance; • somatic stem cell population maintenance; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • regulation of kinase activity; • regulation of cell migration; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • розвиток багатоклітинного організму; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	9079
	16826
	ENSG00000169744
	ENSMUSG00000039706
	O43679
	O55203
	NM_001130834; NM_001290; NM_001304434; NM_001304435
NM_001077398; NM_001286348; NM_010698; NM_001347349; NM_001359070;
	NM_001359071
	NP_001124306; NP_001281; NP_001291363; NP_001291364
NP_001070866; NP_001273277; NP_001334278; NP_034828; NP_001345999;
	NP_001346000
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

LDB2 (англ. LIM domain binding 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 373 амінокислот, а молекулярна маса — 42 793^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSSTPHDPFY	SSPFGPFYRR	HTPYMVQPEY	RIYEMNKRLQ	SRTEDSDNLW
WDAFATEFFE	DDATLTLSFC	LEDGPKRYTI	GRTLIPRYFS	TVFEGGVTDL
YYILKHSKES	YHNSSITVDC	DQCTMVTQHG	KPMFTKVCTE	GRLILEFTFD
DLMRIKTWHF	TIRQYRELVP	RSILAMHAQD	PQVLDQLSKN	ITRMGLTNFT
LNYLRLCVIL	EPMQELMSRH	KTYNLSPRDC	LKTCLFQKWQ	RMVAPPAEPT
RQPTTKRRKR	KNSTSSTSNS	SAGNNANSTG	SKKKTTAANL	SLSSQVPDVM
VVGEPTLMGG	EFGDEDERLI	TRLENTQYDA	ANGMDDEEDF	NNSPALGNNS
PWNSKPPATQ	ETKSENPPPQ	ASQ

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

Semina E.V., Altherr M.R., Murray J.C. (1998). Cloning and chromosomal localization of two novel human genes encoding LIM-domain binding factors CLIM1 and CLIM2/LDB1/NLI. Mamm. Genome. 9: 921—924. PMID 9799849 doi:10.1007/s003359900899
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6533 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, O43679 (англ.) . Архів оригіналу за 8 листопада 2016. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 4

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6533 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, O43679 (англ.) . Архів оригіналу за 8 листопада 2016. Процитовано 30 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]