LIMS2

LIMS2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3IXE
Ідентифікатори
Символи	LIMS2, PINCH-2, PINCH2, LGMD2W, LIM zinc finger domain containing 2, MDRCMTT
Зовнішні ІД	OMIM: 607908 MGI: 2385067 HomoloGene: 41214 GeneCards: LIMS2
Пов'язані генетичні захворювання
	хвороба Альцгеймера, autosomal recessive limb-girdle muscular dystrophy type 2W
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • зв’язування з іоном металу;
Клітинна компонента	• гіалоплазма; • міжклітинні контакти; • клітинна мембрана; • мембрана; • клітинне ядро; • focal adhesion; • цитоплазма; • cell-cell junction;
Біологічний процес	• positive regulation of integrin-mediated signaling pathway; • negative regulation of neural precursor cell proliferation; • cell-cell junction organization; • negative regulation of apoptotic process; • negative regulation of hepatocyte proliferation; • cell junction assembly; • negative regulation of epithelial cell proliferation; • cell-cell adhesion; • positive regulation of substrate adhesion-dependent cell spreading;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	55679
	225341
	ENSG00000072163
	ENSMUSG00000024395
	Q7Z4I7
	Q91XD2
	NM_001136037; NM_001161403; NM_001161404; NM_001256542; NM_017980
	NM_144862; NM_001365015; NM_001379137; NM_001379138
	NP_001129509; NP_001154875; NP_001154876; NP_001243471; NP_060450
	NP_659111; NP_001351944; NP_001366066; NP_001366067
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

LIMS2 (англ. LIM zinc finger domain containing 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 2-й хромосомі.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 341 амінокислот, а молекулярна маса — 38 916^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTGSNMSDAL	ANAVCQRCQA	RFSPAERIVN	SNGELYHEHC	FVCAQCFRPF
PEGLFYEFEG	RKYCEHDFQM	LFAPCCGSCG	EFIIGRVIKA	MNNNWHPGCF
RCELCDVELA	DLGFVKNAGR	HLCRPCHNRE	KAKGLGKYIC	QRCHLVIDEQ
PLMFRSDAYH	PDHFNCTHCG	KELTAEAREL	KGELYCLPCH	DKMGVPICGA
CRRPIEGRVV	NALGKQWHVE	HFVCAKCEKP	FLGHRHYEKK	GLAYCETHYN
QLFGDVCYNC	SHVIEGDVVS	ALNKAWCVSC	FSCSTCNSKL	TLKNKFVEFD
MKPVCKRCYE	KFPLELKKRL	KKLSELTSRK	AQPKATDLNS	A

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у клітинній мембрані, ядрі, мембрані, клітинних контактах.

Література

Zhang Y., Chen K., Guo L., Wu C. (2002). Characterization of PINCH-2, a new focal adhesion protein that regulates the PINCH-1-ILK interaction, cell spreading, and migration. J. Biol. Chem. 277: 38328—38338. PMID 12167643 doi:10.1074/jbc.M205576200
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з LIMS2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16084 (англ.) . Процитовано 18 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q7Z4I7 (англ.) . Архів оригіналу за 5 травня 2017. Процитовано 18 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 2

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з LIMS2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16084 (англ.) . Процитовано 18 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-5] UniProt, Q7Z4I7 (англ.) . Архів оригіналу за 5 травня 2017. Процитовано 18 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]